FoundationOne CDx assay

释    义   n. Foundation Medicine公司推出的伴随诊断产品

例    句   Tumor mutational burden was determined by the FoundationOne CDx assay. 肿瘤突变负荷由FoundationOne CDx测定。

概述

FoundationOne CDx assay是Foundation Medicine公司推出的伴随诊断产品。美国FoundationOne CDx（以下简称“F1CDx”）于2017年11月30日由美国FDA批准上市。该产品是第一个基于二代测序的多肿瘤、多位点伴随诊断产品。该产品覆盖了5种肿瘤、涉及17种药物共18种治疗方法。该产品为基于二代测序的体外伴随诊断检测，仅允许在Foundation Medicine公司进行。

整个检测包括试剂、软件、仪器（Illumina的HiSeq 4000平台）和检验的相应规程。该产品针对324个基因进行检测，所检测的突变类型包括替换、插入、缺失、拷贝数变化、基因重排等突变，以及微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷检测。适用的样品类型为福尔马林固定石蜡包埋组织样本（FFPE）。

检测结论

F1CDx检测的结论分为三类：第一类：表1中伴随诊断预期用途的基因情况；第二类：具有显著临床意义的癌症突变；第三类：具有潜在临床意义的癌症突变。

美国FDA依据肿瘤个体化基因与癌症关系证据的可靠程度将癌症个体化基因检测试剂分为三级。F1CDx检测结论的上述分类即符合FDA的分级策略。第一级：伴随诊断（Companion Diagnostics,CDx）。伴随诊断试剂要求测试结果所提供的信息足以保证相应治疗药物的安全性和有效性，其预期用途为指导用药。

第二级：具有显著临床意义的生物标志物的检测试剂，这一类生物标志物根据专业指南中的相关临床证据显示具有非常显著的临床意义，其预期用途是为专业医护人员提供基于检测结果结合相关临床证据得到与治疗相关的信息。

第三级：具有潜在临床意义的生物标志物检测试剂，这一类可以定义为除第一级和第二级之外其他肿瘤突变标志物。根据前述美国FDA对于癌症相关基因标志物的分级方式，F1CDx是一个涵盖三级检测基因的体外诊断试剂。F1CDx在向FDA申请上市前为一个实验室自建检测产品（LDT），因此在临床样本收集、数据积累方面有相应的基础。F1CDx的检测结论不仅包括基因的突变情况，同时包括结果的解读、用药指导、患者后续治疗指导等信息。

审批途径

F1CDx是一个涵盖多项肿瘤的检测产品，按EAP特殊路径审批。EAP指用于危及生命或不可逆的疾病或病症的未能满足的医疗需求的快速通道途径。F1CDx通过EAP途径进行审批，基于肿瘤危及生命但尚未被解决的医疗需求。同时，F1CDx是美国FDA第一个通过“突破性产品”分类途径（BreakThrough Designation，以下简称“突破性途径”）审批上市的IVD产品。“突破性途径”是2015年美国FDA最初提出的对创新性产品加快审批政策经过不断改进后的上市审批政策，目前仍处于征求意见阶段。进入“突破性途径”后，CDRH会进一步加强与申请人的互动、个性化方案制定及审评优先。

小结

基于二代测序的多肿瘤、多位点伴随诊断产品检测结果不仅包含基因突变，同时应当包含对结果分析。美国FDA对于该类产品依然采用基于风险控制的条件性审批，不同检测机构解读能力存在差异，该产品整个检测过程仅能在Foundation Medicine公司进行；

同时，美国FDA对该类产品的分级策略更加清晰，伴随诊断相关基因检测依然要求最高，每类突变基因均需要提交临床研究数据支持伴随诊断预期用途；对于该类产品，无论伴随诊断相关突变基因还是该产品其他突变基因，均应充分考虑分析性能，临床研究，结果解读，软件设置，数据库架构等涉及该类产品相关研究资料，以降低该类产品潜在的检测错误和解读错误风险，保证该类产品检测的安全性、有效性。