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Next generation sequencing

肿瘤

关键词肿瘤 诊断方式 肿瘤基础研究

词汇介绍

拓展阅读

解析

Next   英 /nekst/   美/nɛkst/

       adj. 紧接在后的;贴近的;其次的;adv. 然后;下次;其次;n. 下一个人或事件;prep. 靠近;居于…之后;det. 下次;紧接在后的;另一个

       What do you think I should do next?  你认为我下一步该怎么办呢?

 

Generation   英 /dʒenə'reɪʃ(ə)n/   美/'dʒɛnə'reʃən/

       n. 一代;产生;一代人;生殖

同根词   generative adj. 生殖的;生产的;有生殖力的;有生产力的;generational adj. 一代的;生育的;generator n. 发电机;发生器;生产者;generate vt. 使形成;发生;生殖

       I weep for our generation!  我为我们这一代哀悼!

 

Sequencing   英 /'siːkwənsɪŋ/   美/'sikwənsɪŋ/

       n. [计] 排序;[计] 定序;排列程序;v. [计] 定序(sequence的ing形式);使按顺序排列

       In this paper, comparison of the sequencing comparison, hoping to find a suitable algorithm.  本文主要对比各排序进行对比,希望能找出一种合适的算法。

概述

NGS测序技术,是指不基于sanger的高通量DNA测序技术。可以同时对数以百万计或数十亿计的DNA链进行测序,从而大大提高通量。相对于传统的一代测序(sanger测序)来说,二代测序的优点是通量高,缺点是读长短,目前主流的Illumina公司的测序平台常用的读长模式是150PE或者100PE。 原理二代测序从最开始发展时先后出现了罗氏454平台、Illumina HiSeq系列平台以及ABI公司的Solid平台,测序原理分为合成法测序以及链接法测序。随着技术的不断发展,目前只有I

Current and future perspectives of liquid biopsies in genomics-driven oncology复制标题

基因组学驱动的肿瘤学中液体活检的当前和未来展望

发表时间:2018-11-08

影响因子:43.7

作者: Ellen Heitzer

期刊:Nat. Rev. Genet.

The key objective of precision oncology is to improve diagnosis and treatment of cancer. To this end, a variety of genomic and other molecular analyses can be applied to tumour material to help identify known predictive markers to guide the selection of treatment, derive a molecular subtype classification that might enable estimation of the prognosis, characterize somatic alterations involved in tumour progression, detect disrupted pathways and identify molecular discriminants of metastatic disease. Although a range of  next-generation sequencing (NGS)-based approaches have been used to characterize tumour genomes in detail, a more accurate classification of tumour types can be achieved through comprehensive, multiparameter analyses. For example,  The Cancer Genome Atlas (TCGA) research network generated comprehensive molecular profiles at the DNA, RNA, protein and epigenetic levels for hundreds of tumours.

译文

精确肿瘤学的关键目标是改善癌症的诊断和治疗。 为此,可以将多种基因组和其他分子分析应用于肿瘤材料,以帮助鉴定已知的预测标记物以指导治疗的选择,推导出可以估计预后的分子亚型分类,表征肿瘤中涉及的体细胞改变。 进展,检测破坏的途径并确定转移性疾病的分子判别。 尽管已经使用一系列基于下一代测序(NGS)的方法来详细表征肿瘤基因组,但是通过全面的多参数分析可以实现更准确的肿瘤类型分类。 例如,癌症基因组图谱(TCGA)研究网络在数百种肿瘤的DNA,RNA,蛋白质和表观遗传水平上产生了全面的分子谱。