肾内泌尿
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解析
CircSMARCA5
释 义 n. 环状RNA SMARCA5
例 句 The expression of circular RNA SMARCA5 (circSMARCA5) in tissues and plasma samples was detected by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR).通过实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测环状RNA SMARCA5 (circSMARCA5)在组织样本和血浆样本中的表达。
概述
概述
环状RNA(circRNA)是一类天然存在的可替代RNA剪接的分子,它可以抑制微小RNA(miRNA)在真核细胞中的表达。与线性RNA不同,circRNA是圆形RNA,这种单链共价闭合的环状结构于1976年首次在植物类病毒中发现,1979年人类在真核细胞细胞质中首次发现。其作为一种广泛而多样的内源性非编码RNA,具有巨大的调控潜力。SMARCA5基因的全称是SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5。circSMARCA5在非编码转录物或特定基因的3’-UTR中含有miRNA的结合位点,circSMARCA5可以竞争性的结合miRNA,形成miRNA海绵,在肿瘤的发生发展中发挥重要作用。
与前列腺癌的关系
对前列腺癌组织和正常组织进行实时定量PCR检测,结果发现与正常的组织相比,在前列腺癌组织中circSMARCA5表达上调,进一步功能试验显示,circSMARCA5可以作为前列腺癌中的致癌基因,抑制细胞凋亡。circSMARCA5沉默可以显著抑制LNCaP-AI和DU145细胞增殖。同时,其表达水平下调使前列腺癌G1期细胞数量增加,S期细胞数量下降,还可以促进前列腺癌细胞系中细胞凋亡。后来有研究者进一步研究发现,MiR-432是circSMARCA5的直接靶点,circSMARCA5通过MiR-432在前列腺癌细胞中加速了前列腺癌的发展。PDCD10是miR-432的直接靶点,PDCD10逆转了miR-432积累对前列腺癌细胞增殖、转移和糖酵解的抑制作用。CircSMARCA5通过海绵作用miR-432在前列腺癌细胞中上调PDCD10的表达。说明CircSMARCA5通过miR-432/PDCD10轴促进前列腺癌的恶化。CircSMARCA5/miR-432/PDCD10轴可能是前列腺癌治疗的潜在治疗靶点。
circSMARCA5在肿瘤中的其它作用机制
circSMARCA5可以通过影响富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子1(SRSF1)的表达和功能,进而调节肿瘤细胞迁移能力。SRSF1是一种富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子1,除了参与剪接之外,SRSF1还具有其他的功能如下:(i)调节RNA代谢;(ii)调节mRNA翻译; (iii)调控miRNA加工;(iv)参与蛋白质SUMO化;(v)与应激反应有关。circSMARCA5与SRSF1之间的物理的相互结合作用,从而导致了临床相关血管内皮生长因子A(VEGFA)前mRNA的剪接产生的促血管生成亚型和抗血管生成亚型比例的变化。经RBPMap数据库预测,CircSMARCA5至少含有七个不同的进化保守的SRSF1结合位点。SRSF1的RIP实验证明了CircSMARCA5和SRSF1的相互结合作用(SRSF3 mRNA是阳性对照)。
与其它肿瘤的关系
circSMARCA5与多种肿瘤的发生发展都有重要的关系。比如,有研究人员采用实时定量聚合酶链反应检测环状RNA SMARCA5在肝癌组织和血浆中的表达,结果显示,与癌旁组织相比,circSMARCA5在HCC组织中的表达明显下调。通过一系列实验表明circSMARCA5可能促进肝癌细胞的凋亡,抑制肝癌细胞的增殖、侵袭和转移。CircSMARCA5可能作为HCC的潜在预测和监测生物标志物,特别是在AFP超过截止值的HCC患者中。还有研究表明其与胃癌、多形性胶质母细胞瘤等的发生发展都有关系。
CircSMARCA5通过结合SRSF1调节多形性胶质母细胞瘤中VEGFA mRNA剪接和血管生成
发表时间:2019-02-07
影响指数:6.2
作者: Barbagallo D
期刊:Cancers (Basel)
Circular RNAs are a large group of RNAs whose cellular functions are still being investigated. We recently proposed that circSMARCA5 acts as sponge for the splicing factor Serine and Arginine Rich Splicing Factor 1 (SRSF1) in glioblastoma multiforme (GBM). After demonstrating by RNA immunoprecipitation a physical interaction between SRFS1 and circSMARCA5, we assayed by real-time PCR in a cohort of 31 GBM biopsies and 20 unaffected brain parenchyma controls (UC) the expression of total, pro-angiogenic (Iso8a) and anti-angiogenic (Iso8b) mRNA isoforms of Vascular Endothelial Growth Factor A (VEGFA), a known splicing target of SRSF1. The Iso8a to Iso8b ratio: (i) increased in GBM biopsies with respect to UC (p-value < 0.00001); (ii) negatively correlated with the expression of circSMARCA5 (r-value = -0.46, p-value = 0.006); (iii) decreased in U87-MG overexpressing circSMARCA5 with respect to negative control (p-value = 0.0055). Blood vascular microvessel density, estimated within the same biopsies, negatively correlated with the expression of circSMARCA5 (r-value = -0.59, p-value = 0.00001), while positively correlated with that of SRSF1 (r-value = 0.38, p-value = 0.00663) and the Iso8a to Iso8b ratio (r-value = 0.41, p-value = 0.0259). Kaplan-Meier survival analysis showed that GBM patients with low circSMARCA5 expression had lower overall and progression free survival rates than those with higher circSMARCA5 expression (p-values = 0.033, 0.012, respectively).
译文