神经
词汇介绍
拓展阅读
解析
complementary 英 [ˌkɒmplɪˈmentri] 美 [ˌkɑːmplɪˈmentri]
释 义 adj. 补足的;互补的;补充医学的;辅助性的;互补色的;余角的
同根词 complemental adj. 补足的;补充的;补偿的
complement n. 补语;余角;补足物
例 句 I think they are very complementary. 我想他们是非常互补的。
deoxyribonucleic 英 [di:'ɔksi,raibəu'nju:kli:ik]
释 义 adj. 脱氧核糖核的
例 句 We have explored causes of the variation of deoxyribonucleic acid: It is probable that chemical reactions give rise to the variation or that physical interactions give rise to the variation. 我们探索脱氧核糖核酸分子变异的原因:它可能由化学反应引起;也可能由物理作用引起。而物理作用引起的变异表现得更明显。
acid 英 [ˈæsɪd] 美 [ˈæsɪd]
释 义 n. 酸
adj. 酸的;讽刺的;刻薄的
例 句 Roses will not root in such acid soil. 玫瑰在这种酸性土壤中不会生根。
概述
概述
cDNA文库的构建概述cDNA,也称为互补脱氧核糖核酸,是指包含种生物体所有基因编码的cDNA分子的克隆群。它是以信使RNA(mRNA)为模板,在逆转录酶的催化作用下,形成的互补cDNA。之后将其与适当的载体连接后转化为受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的互补DNA(cDNA)克隆集合即称为该组织细胞的cDNA文库。
构建过程
自20世纪70年代中叶首例cDNA克隆问世以来,已发展了许多种提高cDNA合成效率的方法,并极大地改进了载体系统,目前cDNA合成试剂已商品化。cDNA文库的构建包括5个阶段,分别是:①mRNA的分离和纯化;②2cDNA双链的合成;③cDNA的甲基化;④cDNA与载体连接;⑤噬菌体的包装、转染及质粒DNA的转化。
构建方法
(1)mRNA的分离和纯化实验原理。真核生物mRNA的提取一般有两条途径:一条是先提取多聚核糖体,再将蛋白质与mRNA分开,即利用抗原抗体的反应,将含量极微的、特异的mRNA提取出来。另外一条是提取细胞总RNA,然后利用寡聚脱氧胸腺嘧啶核苷酸纤维素柱层析或磁捕获杂交法把mRNA与其他的RNA,如与转运RNA,核糖体RNA等分开。
(2)mRNA的分离和纯化方法。纤维素柱层析法和磁捕获杂交法。
RNA proximity sequencing data and analysis pipeline from a human neuroblastoma nuclear transcriptome复制标题
来自人神经母细胞瘤核转录组的RNA接近测序数据和分析管道
发表时间:2020-01-28
影响指数:5.9
作者: StevenW Wingett
期刊:Sci Data
We have previously developed and described a method for measuring RNA co-locations within cells, called Proximity RNA-seq, which promises insights into RNA expression, processing, storage and translation. Here, we describe transcriptome-wide proximity RNA-seq datasets obtained from human neuroblastoma SH-SY5Y cell nuclei. To aid future users of this method, we also describe and release our analysis pipeline, CloseCall, which maps cDNA to a custom transcript annotation and allocates cDNA-linked barcodes to barcode groups.
译文