2019-nCoV 基因组的蛋白质结构和序列重分析反驳了蛇作为其中间宿主或其刺突蛋白插入与 HIV-1 之间的独特相似性。

临床2019-nCoV 基因组的蛋白质结构和序列重分析反驳了蛇作为其中间宿主或其刺突蛋白插入与 HIV-1 之间的独特相似性。

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影响指数：3.86
期刊：Journal of proteome research
发表时间：2020-03-22
DOI：10.1021/acs.jproteome.0c00129 复制DOI

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随着 2019-nCoV 冠状病毒的感染正在迅速发展成为全球肺炎流行病，迫切需要仔细分析其传播和细胞机制。在本报告中，我们首先分析了最近的两项研究，这些研究得出结论，蛇是 2019-nCoV 的中间宿主，2019-nCoV 刺突蛋白插入与 HIV-1 具有独特的相似性。使用最先进的生物信息学方法和数据库在更大规模的数据集上构建的分析的重新实施，提出了反驳这些结论的明确证据。接下来，使用来自 Manis javanica 的宏基因组样本，我们组装了 2019-nCoV 样冠状病毒的基因组草图，其显示了 73% 的覆盖率和 91% 的序列同源性。特别是，与 2019-nCoV 相比，刺突表面糖蛋白受体结合域的比对显示 bat 冠状病毒 RaTG13 的变异是 Manis 冠状病毒的 4 倍。提示穿山甲是蝙蝠向人类传播 2019-nCoV 的缺失环节。

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