临床流感病毒在拉丁美洲选定国家中的遗传进化,2017-2018。
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- 影响指数:3.02
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期刊:PloS one
- 发表时间:2020-03-10
- DOI:10.1371/journal.pone.0227962
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目的: 自 2009 流感大流行以来,拉丁美洲国家加强了流感监测系统。我们分析了 2017 至 2018 年南半球 (SH) 流感季节的流感基因序列数据,从选定的洛杉矶国家绘制流感基因序列数据的可用性,并描述,洛杉矶 2017 至 2018 年SH流感季节。
方法: 我们分析了甲型流感/H1pdm09,A/H3,维多利亚和B/山形血凝素序列临床标本来自 12 个国家流感中心 (nic),十个国家 (阿根廷,巴西、智利、哥伦比亚、哥斯达黎加、厄瓜多尔、墨西哥、巴拉圭、秘鲁和乌拉圭) 收集日期从流行病学周 (EW) 18,2017 通过EW 43,2018。这些序列由国家信息中心或美国疾病控制和预防中心的世卫组织合作中心 (CC) 生成,上传到全球共享流感数据倡议 (GISAID) 平台,并用于系统发育重建。
检测结果: 来自参与国家的流感血凝素序列 (A/H1pdm09 n = 326,A/H3 n = 636,B n = 433) 与流感疫苗推荐的甲型流感/H1pdm09 和乙型流感病毒的遗传组高度一致。对于流感A/H3,一致性是可变的。
结论: 考虑到流感病毒的不断进化,高质量的监测数据 -- 特别是基因序列数据,对于让公共卫生决策者做出关于预防和控制策略的知情决策是重要的,如流感疫苗的组成。在洛杉矶进行流感基因测序监测的国家应继续与世卫组织CCs合作,以产生高质量的基因序列数据,并将这些序列上传到开放获取数据库。