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临床通过全基因组序列分析的甲型H1N1 流感pdm09 的流行以及缅甸 2017 的第一例奥司他韦耐药株。 复制标题

  • 影响指数:3.02
  • 期刊:PloS one
  • 发表时间:2020-03-04
  • DOI:10.1371/journal.pone.0229601 复制DOI

研究方向

流感

: 2017 年在缅甸观察到人类甲型H1N1 流感pdm09 病毒株的社区爆发。我们调查了 2017 甲型H1N1 流感的循环模式,抗原性和耐药性来自缅甸的pdm09 病毒es,并表征了来自住院患者和门诊患者的缅甸流感病毒株的全基因组,以评估病毒es的致病性。2017 年 1-12 月间,在缅甸仰光和Pyinmana市收集了急性呼吸道感染门诊和住院患者的鼻咽拭子。通过病毒分离和实时rt-pcr共检测 215 例门诊患者和 18 例住院患者感染A(H1N1)pdm09。阳性患者中,小于 14 岁者占 90.6%。缅甸针对A(H1N1)pdm09 病毒的血凝抑制 (HI) 抗体滴度与 2017-2018 季节推荐的日本流感疫苗株相似 (A/Singapore/GP1908/2015) 和世卫组织推荐的 2017 南半球疫苗组分 (A/Michigan/45/2015)。血凝素序列的系统进化分析表明,缅甸菌株属于基因亚单位 6B.1,在潜在抗原位点具有S162N和S164T突变。然而,未发现在位置 222 处的氨基酸突变,其可增强疾病的严重性和死亡率。1 例既往无奥司他韦治疗史的病例在神经氨酸酶 (NA) 中携带H275Y突变病毒,其赋予对奥司他韦和帕拉米韦的抗性,IC50 值升高。缅甸株的全基因组序列显示,来自住院患者和门诊患者的样品之间没有差异,表明没有与患者严重程度相关的额外病毒突变。与疫苗株和其他亚洲株相比,在缅甸株的PB2 、PB1 和M2 中观察到几种氨基酸变化。然而,在缅甸菌株中没有发现与致病性相关的突变,这表明病毒因素无法解释缅甸大规模爆发的根本原因。这项研究报告首次在缅甸发现了一种对奥司他韦耐药的流感病毒,突出了缅甸流感病毒持续抗病毒监测和基因特征分析的重要性。

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