临床流感A/H3N2 抗原转换的早期预测。
复制标题
- 影响指数:4.35
-
期刊:PLoS computational biology
- 发表时间:2020-02-18
- DOI:10.1371/journal.pcbi.1007683
复制DOI
: 流感A/H3N2 是一种快速进化的病毒,每 2 至 8 年经历一次主要的抗原转变。预测转变的时机和结果对于开发有效的季节性流感疫苗至关重要。使用已发表的流感传播系统发育模型,我们确定了新兴抗原簇未来进化成功的指标,并量化了我们做出这种预测的能力的基本权衡。一个新集群的最终命运取决于其最初的流行病学增长率 -- 这是一个突变负荷和群体对集群的易感性的函数 -- 以及在共同循环中的增长率的变化病毒。逻辑回归可以预测 5% 相对频率的聚类是否最终会成功,灵敏度约为 80%,提供长达八个月的预警。随着集群的扩大,预测会改善,而疫苗开发和其他干预措施的准备时间会减少。然而,试图从 12 年的经验流感监测数据中做出可比较的预测,这些数据更加稀疏和粗粒度,只有 56% 的灵敏度。通过扩大流感监测以获得对新出现病毒的频率和人群易感性的更精细估计,我们可以更好地预测主要的抗原转变。这为加速疫苗生产周期提供了额外的激励,以减少菌株选择所需的提前期。